Un soir, Yakumo, jeune habitant de Tokyo, rencontre Paï. Elle est porteuse d'un message du père de Yakumo, disparu il y a plusieurs années au Tibet. Dans ce courrier, Yakumo apprend que Paï est la dernière survivante d'une race mystérieuse, dotée de pouvoirs surnaturels, et qu'il doit l'aider à se tranformer en être humain. Nos deux héros partent alors pour une suite d'aventures fantastiques à travers le monde...

3x3 Eyes est un manga fantastique, unique en son genre. Il est considéré comme une des plus fascinantes séries jamais produites au Japon. En dépit du nombre de volumes, le scénario reste toujours captivant : les aventures des deux héros se succèdent, toutes plus fantastiques les unes que les autres, avec des combats de plus en plus majestueux.