La terre subis de grave condition climatique, et d’immenses catastrophes naturels apparaissent régulièrement, l’eau a ainsi pris possession d’une grande partie des continents, pour le sauvetage de l’humanité deux grands groupes sont mis en place, l’un à pour projet de créer une citée sous marine l’autre de réparer un vaisseau intergalactique. Le seul point commune qu’ils ont c’est l’utilisation des « Brain Powerd » des robot organiques contrôles pas de jeunes pilotes, Isamu Yû en fait partie, un jour il rencontre Utsumiya Hime et sa vie bascule....